Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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PTPRCP08575 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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PTPRCP08575 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRCP08575 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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