Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms