Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 COL12A1-207ENST00000483888 9637 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RYR3Q15413 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms