Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.5 ms