Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC138409.1-201ENST00000505001 3598 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 CTNNA2-201ENST00000343114 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 EDA-213ENST00000616899 4643 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 POLR3B-202ENST00000539066 4118 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
TRHP20396 SMC6-207ENST00000448223 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 PIWIL3-205ENST00000616349 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 APEX2-201ENST00000374987 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 ZNF385B-202ENST00000409343 2750 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TRHP20396 EFNA5-201ENST00000333274 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 GABRB3-225ENST00000638099 2752 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 NBPF19-203ENST00000578189 5034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 AC048344.3-201ENST00000605512 251 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TRHP20396 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms