Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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CCDC142Q17RM4 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CCDC142Q17RM4 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CCDC142Q17RM4 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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