Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms