Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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ITGA9Q13797 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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ITGA9Q13797 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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ITGA9Q13797 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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ITGA9Q13797 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGA9Q13797 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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