Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PGGT1BP53609 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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PGGT1BP53609 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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