Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX15Q9NRS6 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms