Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CCDC93Q567U6 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CCDC93Q567U6 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CCDC93Q567U6 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CCDC93Q567U6 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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