Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PTCH1Q13635 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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PTCH1Q13635 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTCH1Q13635 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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