Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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