Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TM6SF1Q9BZW5 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms