Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1AQ15573 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms