Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SS18Q15532 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms