Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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