Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXF2Q12947 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms