Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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