Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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