Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SSPNQ14714 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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