Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
DUSP4Q13115 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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