Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms