Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
MIS18AQ9NYP9 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms