Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CTXN3Q4LDR2 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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