Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP41Q3LFD5 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP41Q3LFD5 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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