Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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FXNQ16595 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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FXNQ16595 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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FXNQ16595 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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FXNQ16595 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FXNQ16595 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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