Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HOXA3O43365 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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