Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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USP35Q9P2H5 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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