Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
EHD3Q9NZN3 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms