Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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ITGB3BPQ13352 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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ITGB3BPQ13352 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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ITGB3BPQ13352 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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ITGB3BPQ13352 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGB3BPQ13352 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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