Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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SGCGQ13326 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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SGCGQ13326 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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SGCGQ13326 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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SGCGQ13326 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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SGCGQ13326 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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SGCGQ13326 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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SGCGQ13326 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SGCGQ13326 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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