Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RN7SL403P-201ENST00000481783 305 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SNHG19-201ENST00000563192 342 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 USP2-AS1-205ENST00000578923 895 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LINC00663-205ENST00000589508 432 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC113554.1-201ENST00000606284 490 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC016876.3-201ENST00000610459 426 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC131159.2-201ENST00000613236 702 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 BTF3L4-202ENST00000472944 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ADH7-205ENST00000482593 1420 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 MMGT1-201ENST00000305963 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZNF701-201ENST00000301093 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZNF613-201ENST00000293471 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SNPHO15079 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LINC02111-201ENST00000505158 2312 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CWC27-204ENST00000508024 2103 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PIGK-201ENST00000359130 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 FCAR-201ENST00000345937 608 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ASS1P5-201ENST00000435496 1239 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 GHRL-207ENST00000437422 443 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC005077.3-202ENST00000437494 300 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 WDR82P1-201ENST00000439836 939 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 Z82173.1-201ENST00000453924 484 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC012501.1-201ENST00000454312 555 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PAX8-AS1-208ENST00000456685 1207 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RN7SL333P-201ENST00000476398 297 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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SNPHO15079 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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SNPHO15079 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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SNPHO15079 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZNF493-205ENST00000596302 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC003002.3-201ENST00000597410 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AP003121.1-201ENST00000609845 414 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 VAMP3-201ENST00000054666 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 IPP-202ENST00000396478 3113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SNPHO15079 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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