Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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