Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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CCDC142Q17RM4 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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CCDC142Q17RM4 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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CCDC142Q17RM4 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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CCDC142Q17RM4 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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CCDC142Q17RM4 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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CCDC142Q17RM4 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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CCDC142Q17RM4 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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