Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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SEC23BQ15437 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SEC23BQ15437 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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