Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPN13Q12923 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms