Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRMP28827 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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