Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VPREB1P12018 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms