Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPRCP08575 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms