Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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