Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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