Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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