Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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IFT88Q13099 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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IFT88Q13099 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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IFT88Q13099 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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IFT88Q13099 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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