Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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