Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
E2F1Q01094 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms