Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
ARID4AP29374 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms