Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RfxankQ9Z205 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxankQ9Z205 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxankQ9Z205 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxankQ9Z205 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxankQ9Z205 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxankQ9Z205 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxankQ9Z205 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RfxankQ9Z205 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms