Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms