Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms